Родилась в 1977 году. В 2000 году окончила Новосибирский государственный технический университет (факультет бизнеса, специальность «Финансы и кредит»), в 2005 году прошла профессиональную переподготовку в рамках Федеральной программы подготовки управленческих кадров для организаций народного хозяйства Российской Федерации, в 2011 окончила обучение по программе «Мастер делового администрирования» в школе менеджмента г.Антверпен, Бельгия («Executive Master of Business Administration», Antwerp Management School).
С 2000 по 2006 годы работала на разных должностях в банках и коммерческих структурах.
2006-2012: ЦФТ
С 2006 года по ноябрь 2012 года работала руководителем отдела бизнес-сопровождения в ГК «ЦФТ - Центр Финансовых Технологий», ЗАО «Золотая Корона», направления процессинговых сервисов, реализовывала проект «Транспортные и социальные карты» (безналичная оплата проезда при помощи бесконтактных технологий в десяти регионах России).
2012-2014: Замдиректора департамента в Минкомсвязи
В ноябре 2012 года перешла в Министерство связи и массовых коммуникаций Российской Федерации. В должности заместителя директора департамента государственной политики в области информатизации органов власти отвечала за совместные проекты в части компетенций Минкомсвязи России сфере электронного здравоохранения (Единая государственная информационная система здравоохранения (ЕГИСЗ), а также непосредственно обеспечивала координацию мероприятий, проводимых Минкомсвязью по повышению позиций России в международных рейтингах, связанных с ИКТ.
В 2013 году от имени Минкомсвязи выступала оппонентом Минздрава на общественных слушаниях по поводу аренды ЦОДа для ЕГИСЗ.
2014: Директор департамента ИТ в Минздраве
С конца июля 2014 г. - директор ИТ-департамента Минздрава России (сменила на этом посту Романа Ивакина).
2018: Замминистра здравоохранения
Распоряжением премьер-министра России Дмитрия Медведева от 30 декабря 2018 года Елена Бойко назначена заместителем министра здравоохранения РФ. Соответствующий документ опубликован на сайте правительства 3 января 2019 года.
На новой посту она будет курировать цифровое развитие министерства, одним из ключевых элементов которого является Единая государственная информационная система в области здравоохранения (ЕГИСЗ).
О развитии ЕГИСЗ, а также настоящем и будущем цифрового здравоохранения в России, в декабре 2018 года в интервью TAdviser рассказывал Константин Солодухин, генеральный директор «Национального центра информатизации», входящего в ГК Ростех.
Доходы
2014
Согласно декларации, опубликованной на сайте Минздрава, доход Бойко в 2014 году составил 1 305 926,55 рублей. В ее индивидуальной собственности есть квартира 50,9 кв. м., в совместной - еще одна площадью 63,3 кв. м. Автомобиль - Chevrolet Cruze.
2013
В декларации, опубликованной на сайте Минкомсвязи, сказано, что доход Бойко в 2013 году составил 818 341,16 рублей. В ее полной собственности была квартира 54 кв. м. и автомобиль Chevrolet Cruze. Еще одна квартира принадлежала чиновнице на треть.
Рейтинги
В 2015 году включена в список TAdviser "Топ-10 женщин в российской ИТ-отрасли 2015"