История Воскресенского Ново-Иерусалимского монастыря тесно связана с памятью его основателя Святейшего Патриарха Никона. Обитель эта была любимейшей из трех основанных Святейшим Патриархом монастырей: Иверского, Крестного и Воскресенского. Здесь он прожил более восьми лет после своего удаления из Москвы, и все свои силы употребил на воплощение своего замысла – создать в Подмосковье точное подобие знаменитого Иерусалимского храма Воскресения Господня.
Ему хотелось дать возможность русскому народу созерцать места спасительных страстей и Воскресения Христова, не подвергаясь дорогостоящему и небезопасному путешествию на Ближний Восток.
Великое дело было начато Патриархом в 1656 году, во время его дружбы с Царем Алексеем Михайловичем. Оно продолжалось при его пособии даже в период охлаждения этой дружбы с 1658 по 1666 гг. Почти на 14 лет приостановилось создание монастыря со ссылкой Патриарха в конце 1666 года, но возобновилось усердием Царя Федора Алексеевича и благодаря старанию его тетки Царевны Татьяны Михайловны в 1679 году. В его же царствование исполнилось и желание Патриарха живым или мертвым вернуться в свою любимую обитель, он получил позволение вернуться в Новый Иерусалим, но скончался на пути из ссылки. Он был погребен в приделе Усекновения Главы Иоанна Предтечи Воскресенского собора 26 августа 1681 года (ст. ст.).