Работой Восточно-Европейского института Психоанализа руководит Ученый совет.
Непосредственное управление осуществляет ректор - доктор психологических наук, кандидат медицинских наук, профессор Решетников Михаил Михайлович, член проблемной комиссии по медицинской психологии Министерства здравохранения Российской Федерации и РАН, президент Национальной Федерации Психоанализа, член правления Российской Психотерапевтической Ассоциации и Всероссийской Профессиональной Психотерапевтической Лиги, член Европейской Федерации Психотерапии.
Первый проректор - кандидат психологических наук Муханова Надежда Александровна, т/ф(812) 345-22-91, prorector@oedipus.ru
Проректор по научной работе - кандидат психологических наук, старший научный сотрудник - Баранов Юрий Александрович.
Проректор по клинической работе - Куликов Андрей Иванович.
Исполнительный директор - Ткачева Светлана Викторовна, т. (812)230-30-74, sv.tkacheva@gmail.com
Учебный отдел:
Дневное отделение - Грибова Екатерина Геннадьевна,
Вечернее отделение - Аветисова Елена Карлосовна,
Заочное отделение - Мелкая Марина Витольдовна
Институт является членом первого "Университетского образовательного округа", созданного под патронажем государственного педагогического университета им. А.И.Герцена, а также членом Ассоциации негосударственных ВУЗов Северо-западного региона.
