Заместитель руководителя клиники хирургии открытого сердца и аорты, доктор медицинских наук, профессор; в 1956 г. окончил 1-й Московский медицинский институт им. И.М.Сеченова; является одним из учеников выдающегося русского хирурга, академика Б.В.Петровского, под руководством которого прошел путь от клинического ординатора до заведующего отделением хирургии ишемической болезни сердца Российского Научного Центра Хирургии РАМН; лауреат Государственной премии СССР (1988 - "За разработку и внедрение в клиническую практику методов хирургического лечения ишемической болезни сердца"); Заслуженный деятель науки РФ (1998); член Российской Ассоциации сердечно-сосудистых хирургов; автор 3 монографий и более 300 научных работ по различным проблемам кардиохирургии.
Является одним из основоположников хирургии ишемической болезни сердца в Советском Союзе и России. Им разработаны и внедрены в клиническую практику различные методы хирургического лечения больных ишемической болезнью сердца. В 1978 году Б.Шабалкин обобщил опыт операций реваскуляризации миокарда в монографии "Хирургия хронической ишемической болезни сердца", которая стала первым отечественным практическим руководством по коронарной хирургии и сыграла неоценимую роль в распространении хирургического лечения этого заболевания в нашей стране. Проведены многогранные научные исследования, посвященные вопросам патофизиологии коронарного кровообращения, оценке сократительной функции миокарда при ишемической болезни сердца, определению показаний к аортокоронарному шунтированию. Им научно обоснована необходимость использования аутоартериальных трансплантатов для восстановления коронарного кровообращения, доказана высокая эффективность аутоартериальной реваскуляризации миокарда.
